Ateistlerin açıklayamadığı iddia edilen şeyler, genellikle dinin ve doğaüstü inançların kapsamına giren konulardır. Ancak, ateizm bir inanç sistemi değildir ve ateistler, doğaüstü olaylar ve fenomenler hakkında bilimsel, mantıksal ve rasyonel açıklamalar yapmaya çalışırlar.
Bazı insanlar, ateistlerin açıklayamadığı iddia edilen şeyler arasında evrenin yaratılışı, yaşamın kökeni, insan bilincinin kaynağı, evrenin varoluş amacı, ölüm sonrası hayat gibi konular yer alabilir. Ancak, bu konular insanlık tarihi boyunca farklı dinler, felsefeler ve bilimsel teoriler tarafından ele alınmıştır ve ateistler de bu konulara kendi açılarından yaklaşarak açıklama yapmaya çalışırlar.
Ateistler, bilim ve mantık gibi araçlarla evrenin ve insanlığın nasıl ortaya çıktığını, nasıl işlediğini ve ne anlama geldiğini açıklamaya çalışırlar. Ancak, bazı konularda henüz kesin bilgiye sahip olunmamış olabilir ve bunların açıklanması da zaman alabilir.