Elektron mikroskobu birçok farklı alanda kullanılmaktadır. Bunlardan bazıları:
1. Biyoloji: Elektron mikroskopları, hücre ve doku yapısının incelenmesi, virüslerin görüntülenmesi, hücre içi yapıların belirlenmesi gibi biyolojik araştırmalarda kullanılır.
2. Malzeme Bilimi: Elektron mikroskopları, malzemelerin mikro yapısının incelenmesi, kristal yapının belirlenmesi, malzeme karakterizasyonu ve yüzey analizi gibi alanlarda kullanılır.
3. Nanoteknoloji: Elektron mikroskopları, nanomalzeme ve nanoyapıların incelenmesinde önemli bir araçtır. Nanomalzemelerin şekil, boyut ve yapısının belirlenmesi, nanotüplerin ve nanokristallerin incelenmesi gibi çalışmalarda kullanılır.
4. Kimya: Elektron mikroskopları, kimyasal analizlerde yüzey analizi yapmak için kullanılır. Kimyasal bileşenlerin yapılarının ve dağılımlarının belirlenmesinde yardımcı olur.
5. Fizik: Elektron mikroskopları, manyetizma, yarı iletkenler, süperiletkenlik gibi fiziksel fenomenlerin araştırılmasında kullanılır. Özellikle yapıların elektronik ve manyetik özelliklerinin incelenmesinde önemli bir araçtır.
6. Jeoloji: Elektron mikroskopları, minerallerin yapısının ve bileşenlerinin belirlenmesi, kayaçların mikro yapılarının incelenmesi gibi jeolojik araştırmalarda kullanılır.
Bu sadece birkaç örnek olup, elektron mikroskobu birçok farklı alanda kullanılan çok yönlü bir araçtır.