Bamya tohumları, kuru ve serin bir yerde saklanmalıdır. Hava almayan bir kapta muhafaza edilmesi önemlidir, çünkü nem bu tohumları bozabilir. Önerilen saklama yöntemi, tohumları hava geçirmez bir kap veya cam kavanoz içinde buzdolabında muhafaza etmektir.
Bamya tohumları, doğru şekilde saklandığında genellikle 2-3 yıl boyunca kalitelerini koruyabilirler. Ancak, ne kadar süreyle saklandıklarına ve saklama koşullarına bağlı olarak bu süre değişebilir. Bu nedenle, tohumları düzenli olarak kontrol etmek ve kullanmadan önce tazeliğini kontrol etmek önemlidir. Eğer tohumlar bozulmuş veya küflenmiş görünüyorsa, kullanmadan önce yenisiyle değiştirmek daha iyidir.